Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 PCSK1-202ENST00000508626 2234 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 ATP11AUN-201ENST00000623100 2241 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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SPOCK3Q9BQ16 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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SPOCK3Q9BQ16 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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SPOCK3Q9BQ16 AC022148.2-201ENST00000586176 560 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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SPOCK3Q9BQ16 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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SPOCK3Q9BQ16 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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SPOCK3Q9BQ16 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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SPOCK3Q9BQ16 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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SPOCK3Q9BQ16 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SPOCK3Q9BQ16 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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