Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SYNGAP1Q96PV0 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms