Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms