Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 CCT7P1-201ENST00000406551 1611 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms