Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

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Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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H3F3CQ6NXT2 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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H3F3CQ6NXT2 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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H3F3CQ6NXT2 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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H3F3CQ6NXT2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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H3F3CQ6NXT2 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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H3F3CQ6NXT2 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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H3F3CQ6NXT2 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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H3F3CQ6NXT2 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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