Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM71Q2Q1W2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM71Q2Q1W2 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM71Q2Q1W2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM71Q2Q1W2 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM71Q2Q1W2 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM71Q2Q1W2 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM71Q2Q1W2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM71Q2Q1W2 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM71Q2Q1W2 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM71Q2Q1W2 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM71Q2Q1W2 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM71Q2Q1W2 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM71Q2Q1W2 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM71Q2Q1W2 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM71Q2Q1W2 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM71Q2Q1W2 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM71Q2Q1W2 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM71Q2Q1W2 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM71Q2Q1W2 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM71Q2Q1W2 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM71Q2Q1W2 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM71Q2Q1W2 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM71Q2Q1W2 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM71Q2Q1W2 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIM71Q2Q1W2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRIM71Q2Q1W2 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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