Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NRF1Q16656 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms