Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 GGTA1P-205ENST00000495328 3478 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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CTF1Q16619 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AC119674.2-203ENST00000642129 1675 ntAPPRIS P5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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CTF1Q16619 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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CTF1Q16619 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 KCNH1-205ENST00000638498 3479 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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CTF1Q16619 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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CTF1Q16619 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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CTF1Q16619 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 FAM90A17P-201ENST00000533716 1957 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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CTF1Q16619 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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CTF1Q16619 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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CTF1Q16619 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 CICP19-201ENST00000632944 2357 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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