Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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