Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
E2F1Q01094 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms