Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms