Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 RAB43-204ENST00000393307 4203 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 XPC-201ENST00000285021 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 PJA1-204ENST00000374584 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 HIRIP3-201ENST00000279392 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 CR2-202ENST00000367058 4063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 GGPS1-202ENST00000358966 2740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 DDR1-226ENST00000376569 3783 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AC010997.4-201ENST00000609200 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 CDKL2-201ENST00000307465 2565 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBX1P83916 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 BAIAP2-AS1-202ENST00000577066 4465 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 MAGEA11-202ENST00000355220 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 YWHAB-202ENST00000372839 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AGO2-205ENST00000519980 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 TOMM40L-202ENST00000367988 2708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 PKD2L1-201ENST00000318222 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 AL445647.1-201ENST00000606221 3599 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 FGF11-202ENST00000572907 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 SLC3A1-202ENST00000409229 2909 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 MED24-203ENST00000394127 3456 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX1P83916 C1QTNF3-201ENST00000231338 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 FOXD2-AS1-201ENST00000445551 2509 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 PDGFD-201ENST00000302251 4052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 SLC45A4-201ENST00000024061 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 ARHGAP25-201ENST00000409030 2936 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX1P83916 ARHGAP25-203ENST00000409220 2939 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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