Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX1P78337 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX1P78337 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX1P78337 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX1P78337 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX1P78337 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PITX1P78337 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PITX1P78337 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PITX1P78337 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms