Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 LINC00685-201ENST00000391707 428 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 RN7SL479P-201ENST00000472003 300 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 FAM153C-208ENST00000511189 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 AC100778.4-201ENST00000581232 582 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 SOX2-OT-228ENST00000597828 864 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 PDLIM1P1-201ENST00000604187 969 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 GZMH-201ENST00000216338 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 BNIP1-202ENST00000351486 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 AC090589.3-201ENST00000524412 574 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 AC022167.5-201ENST00000636296 1250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 LYG2-201ENST00000333017 862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 HAX1-204ENST00000457918 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 PDPN-208ENST00000509009 571 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 FOS-205ENST00000555242 629 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 BMS1P8-203ENST00000567036 614 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 NAA60-236ENST00000577013 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 CRYGD-201ENST00000264376 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 AC012100.1-201ENST00000470304 282 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 HNRNPA1P7-201ENST00000521273 963 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 RN7SL460P-201ENST00000582806 258 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 AC009779.7-201ENST00000609031 469 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 AC005519.2-201ENST00000554532 1367 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRCA2P51587 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AL110503.1-201ENST00000457224 534 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 AC245369.3-201ENST00000624687 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BRCA2P51587 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms