Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD1P33897 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD1P33897 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms