Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 EEF1GP3-201ENST00000421044 1288 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 HNRNPA1P9-201ENST00000450624 950 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 AL391822.1-201ENST00000452580 562 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 AC067942.1-202ENST00000471756 1057 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.168-201ENST00000621608 264 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 CARS-216ENST00000639317 135 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 416 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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PTPRMP28827 AL138885.2-201ENST00000420389 539 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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PTPRMP28827 OPRM1-211ENST00000518759 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
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PTPRMP28827 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 AL669831.3-208ENST00000634337 891 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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PTPRMP28827 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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PTPRMP28827 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
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PTPRMP28827 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 AC096677.3-201ENST00000413162 387 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
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PTPRMP28827 OR2A15P-201ENST00000463814 900 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
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PTPRMP28827 AKR1B1P3-201ENST00000525311 588 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 ZNF415-221ENST00000600574 563 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 LMX1A-203ENST00000367893 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 VOPP1-204ENST00000418904 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 SLC29A3-201ENST00000373189 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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