Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFP17480 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFP17480 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFP17480 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFP17480 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFP17480 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFP17480 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFP17480 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFP17480 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFP17480 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFP17480 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFP17480 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFP17480 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFP17480 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFP17480 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFP17480 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFP17480 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFP17480 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFP17480 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFP17480 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFP17480 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBTFP17480 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBTFP17480 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBTFP17480 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFP17480 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFP17480 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFP17480 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFP17480 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFP17480 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFP17480 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFP17480 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFP17480 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFP17480 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFP17480 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFP17480 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFP17480 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFP17480 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFP17480 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFP17480 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFP17480 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFP17480 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFP17480 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFP17480 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFP17480 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFP17480 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFP17480 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFP17480 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFP17480 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFP17480 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFP17480 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFP17480 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFP17480 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFP17480 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFP17480 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFP17480 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFP17480 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFP17480 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFP17480 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFP17480 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFP17480 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFP17480 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFP17480 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFP17480 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFP17480 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFP17480 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFP17480 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFP17480 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFP17480 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFP17480 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFP17480 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms