Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXD8P13378 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms