Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC136698.1-201ENST00000558110 546 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC048382.4-201ENST00000559065 546 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 RN7SL5P-201ENST00000581458 321 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC136475.9-201ENST00000605240 497 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 GOSR2-231ENST00000640007 1425 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 CDCA7L-202ENST00000373934 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 BTN2A2-204ENST00000432533 1570 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 416 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC022634.2-201ENST00000521504 382 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC092634.5-206ENST00000593670 812 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 AL121992.3-201ENST00000606186 346 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 VOPP1-204ENST00000418904 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 CCDC42-202ENST00000539522 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 AP001505.1-201ENST00000569966 824 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC006273.1-201ENST00000606966 861 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 BIN3-212ENST00000640731 450 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 VPREB3-201ENST00000248948 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 VPREB3-202ENST00000398465 503 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC093627.3-201ENST00000467050 574 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC096713.1-201ENST00000514650 978 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC078925.1-201ENST00000535370 568 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 BMF-209ENST00000561282 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC005154.1-202ENST00000578293 999 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 PTMAP5-202ENST00000607242 1162 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DMDP11532 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 RPL13AP5-201ENST00000439189 612 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC245884.8-201ENST00000599382 880 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 LINC00869-208ENST00000621156 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 GSTM2P1-201ENST00000405166 654 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 IL6RP1-201ENST00000417848 1273 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 MIR2277-201ENST00000515916 93 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 PXN-AS1-205ENST00000542314 707 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 EIF5A-207ENST00000572815 811 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC005920.4-201ENST00000573301 492 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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