Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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C9orf172C9J069 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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C9orf172C9J069 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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C9orf172C9J069 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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C9orf172C9J069 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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C9orf172C9J069 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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C9orf172C9J069 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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C9orf172C9J069 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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C9orf172C9J069 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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