Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVV-1B6SEH8 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVV-1B6SEH8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms