Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DKK2Q9UBU2 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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