Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 SGCE-201ENST00000265735 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 BSCL2-203ENST00000360796 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 OPRM1-210ENST00000452687 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 CST2-201ENST00000304725 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 PRDX1-203ENST00000372079 609 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 IGLV3-21-201ENST00000390308 602 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 LINC00618-201ENST00000435624 700 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 MYLK-AS1-203ENST00000485162 587 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 ATP2A2-211ENST00000552636 529 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AC015802.4-203ENST00000592622 570 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 NPL-205ENST00000367555 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 SERPINI1-202ENST00000446050 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 ANO7-203ENST00000402530 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 CSTF3-203ENST00000438862 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AL132656.1-201ENST00000452173 490 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 SLC10A7-208ENST00000511374 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AC012313.2-201ENST00000599952 1154 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 MIR6749-201ENST00000617008 69 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 LINC00923-208ENST00000621777 503 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 OBP2A-203ENST00000371776 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 PIN1P1-202ENST00000439639 301 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AL357140.1-201ENST00000454104 424 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AL358115.1-202ENST00000455257 675 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 LINC01606-208ENST00000521653 557 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AL049871.1-201ENST00000557475 880 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AC127496.3-201ENST00000576032 494 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AC104423.1-201ENST00000591742 728 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 BACH1-AS1-202ENST00000615718 700 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 ALLC-201ENST00000252505 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 KRT41P-201ENST00000393988 1293 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AL133517.1-201ENST00000413412 748 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 RN7SL105P-201ENST00000475661 299 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 RRNAD1-211ENST00000524343 459 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AP002414.5-201ENST00000591853 258 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AC078880.3-201ENST00000603439 1121 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AC016526.4-201ENST00000636059 517 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AZGP1-201ENST00000292401 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 MTA3-204ENST00000406911 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AL355987.2-201ENST00000471502 561 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 KRT18P63-201ENST00000505463 979 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AC091132.3-201ENST00000579701 470 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AC138645.1-201ENST00000582765 470 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 GAS6-AS2-201ENST00000608651 1952 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 LILRA5-201ENST00000432233 1363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms