Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AC010969.2-201ENST00000602458 3231 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 LINC00477-201ENST00000483544 1710 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 DRC7-203ENST00000394337 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TBCCD1Q9NVR7 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms