Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TXNDC17Q9BRA2 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms