Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIN3AQ96ST3 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms