Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms