Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms