Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
APCDD1LQ8NCL9 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms