Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLIP4Q8N3C7 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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CLIP4Q8N3C7 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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CLIP4Q8N3C7 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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CLIP4Q8N3C7 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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CLIP4Q8N3C7 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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CLIP4Q8N3C7 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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CLIP4Q8N3C7 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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CLIP4Q8N3C7 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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CLIP4Q8N3C7 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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CLIP4Q8N3C7 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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CLIP4Q8N3C7 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CLIP4Q8N3C7 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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