Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

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Length 950 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CCDC80Q76M96 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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CCDC80Q76M96 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CCDC80Q76M96 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCDC80Q76M96 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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