Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q6P435 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6P435 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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