Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KLHL22Q53GT1 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms