Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms