Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 IL17REL-201ENST00000341280 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 CAPN13-201ENST00000295055 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ACCS-201ENST00000263776 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 BMP2-201ENST00000378827 3601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 ZNF674-201ENST00000414387 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 RTFDC1-202ENST00000357348 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PLA2G4E-AS1-201ENST00000499478 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 TRERF1-202ENST00000354325 4138 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SHC1-203ENST00000368449 2879 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 GOLGA6L7P-201ENST00000567390 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PHF21B-203ENST00000403565 3586 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 IRS4-201ENST00000372129 3928 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 TK2-206ENST00000527800 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 ARHGAP36-202ENST00000370921 2447 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 NBR1-202ENST00000542611 2703 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 FERMT2-201ENST00000341590 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PEX12-201ENST00000225873 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 ACOT11-201ENST00000343744 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AIF1L-204ENST00000372300 3284 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 GGTA1P-205ENST00000495328 3478 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 RBMXL3-201ENST00000424776 3442 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 IYD-208ENST00000500320 2158 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 STIM1-209ENST00000527651 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 WT1-AS-201ENST00000395900 3828 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 ZNF461-201ENST00000360357 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 SLC4A9-201ENST00000432095 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 CLDN19-201ENST00000296387 2859 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 CYP11B1-204ENST00000517471 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LSAMPQ13449 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 450.3 ms