Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SRSF5Q13243 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SRSF5Q13243 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SRSF5Q13243 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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