Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NPRL3Q12980 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms