Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PTPRJQ12913 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PTPRJQ12913 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PTPRJQ12913 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PTPRJQ12913 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PTPRJQ12913 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PTPRJQ12913 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PTPRJQ12913 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PTPRJQ12913 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PTPRJQ12913 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PTPRJQ12913 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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