Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms