Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA2D1P54289 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms