Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 AL132642.2-201ENST00000623423 1998 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 CDCA2-202ENST00000380665 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 TP53I11-220ENST00000533940 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 RNF219-AS1-209ENST00000606429 2418 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 OVOL1-201ENST00000335987 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 ABCC4-207ENST00000629385 2903 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 PLK4-209ENST00000513090 3123 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 POFUT2-203ENST00000349485 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 FAM177A1-201ENST00000280987 2927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
TGFBR1P36897 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms