Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC27P30260 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC27P30260 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC27P30260 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC27P30260 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC27P30260 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC27P30260 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC27P30260 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDC27P30260 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDC27P30260 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDC27P30260 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms