Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJB2P29033 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJB2P29033 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJB2P29033 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms