Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA5P28066 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA5P28066 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA5P28066 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA5P28066 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA5P28066 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA5P28066 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA5P28066 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA5P28066 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA5P28066 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA5P28066 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA5P28066 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA5P28066 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA5P28066 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA5P28066 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA5P28066 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA5P28066 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA5P28066 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA5P28066 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA5P28066 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA5P28066 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSMA5P28066 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PSMA5P28066 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PSMA5P28066 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PSMA5P28066 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PSMA5P28066 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PSMA5P28066 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PSMA5P28066 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PSMA5P28066 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PSMA5P28066 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms