Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms