Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSRP1P21291 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSRP1P21291 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSRP1P21291 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSRP1P21291 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSRP1P21291 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSRP1P21291 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSRP1P21291 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSRP1P21291 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSRP1P21291 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSRP1P21291 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSRP1P21291 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSRP1P21291 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSRP1P21291 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSRP1P21291 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSRP1P21291 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSRP1P21291 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSRP1P21291 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSRP1P21291 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSRP1P21291 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CSRP1P21291 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CSRP1P21291 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CSRP1P21291 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CSRP1P21291 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CSRP1P21291 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CSRP1P21291 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CSRP1P21291 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CSRP1P21291 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CSRP1P21291 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CSRP1P21291 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CSRP1P21291 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms