Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT13P13646 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT13P13646 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT13P13646 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT13P13646 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT13P13646 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT13P13646 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT13P13646 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT13P13646 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT13P13646 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT13P13646 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT13P13646 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT13P13646 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT13P13646 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT13P13646 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT13P13646 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT13P13646 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT13P13646 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT13P13646 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT13P13646 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT13P13646 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT13P13646 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT13P13646 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT13P13646 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT13P13646 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT13P13646 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms