Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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DEFA4P12838 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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DEFA4P12838 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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DEFA4P12838 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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DEFA4P12838 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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DEFA4P12838 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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DEFA4P12838 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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DEFA4P12838 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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