Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DMDP11532 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DMDP11532 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DMDP11532 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DMDP11532 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DMDP11532 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DMDP11532 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DMDP11532 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DMDP11532 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DMDP11532 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DMDP11532 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DMDP11532 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DMDP11532 HTATIP2-203ENST00000443524 967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DMDP11532 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DMDP11532 OARD1-214ENST00000486443 764 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DMDP11532 AC104759.1-201ENST00000559109 939 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DMDP11532 Metazoa_SRP.168-201ENST00000621608 264 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DMDP11532 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DMDP11532 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DMDP11532 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 AL356583.1-201ENST00000398739 1371 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 PGAM1P10-201ENST00000402426 761 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 TRPM1-210ENST00000559179 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 BMS1P8-203ENST00000567036 614 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 GLB1-203ENST00000399402 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 RTP2-201ENST00000358241 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 ABCD3-201ENST00000315713 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DMDP11532 ZNF114-201ENST00000315849 2206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
DMDP11532 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
DMDP11532 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
DMDP11532 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
DMDP11532 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
DMDP11532 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
DMDP11532 NOS2P3-201ENST00000411468 867 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
DMDP11532 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
DMDP11532 SNAP25-AS1-202ENST00000426491 804 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
DMDP11532 AL162595.1-201ENST00000429227 868 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
DMDP11532 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
DMDP11532 TCP10L-202ENST00000472557 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC016304.1-201ENST00000476363 413 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
DMDP11532 MIR378I-201ENST00000582688 76 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC011479.2-201ENST00000598146 432 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
DMDP11532 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
DMDP11532 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 MRPS16P3-201ENST00000415961 374 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 DHRSX-IT1-201ENST00000437244 651 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC002066.1-201ENST00000446355 514 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 AP003062.1-201ENST00000528497 762 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC003965.2-201ENST00000577140 265 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 IGLV2-33-201ENST00000390302 412 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 RPSAP61-201ENST00000412542 878 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 TUBB8P9-201ENST00000422534 1276 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 TUBB8P10-201ENST00000430210 1279 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DMDP11532 CNN2P1-201ENST00000453616 918 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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