Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 CDA-201ENST00000375071 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 C1orf158-201ENST00000376210 695 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 AL391987.4-201ENST00000377547 439 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 AC007405.2-203ENST00000455988 547 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 AC005154.1-227ENST00000579174 755 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 AC004832.1-204ENST00000610737 1018 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 TMEM107-201ENST00000316425 756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 MED20-204ENST00000409312 932 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 AL929472.4-201ENST00000447422 691 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 C8orf37-AS1-203ENST00000521905 617 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 AC097634.2-201ENST00000615819 604 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 UBR1-212ENST00000627960 189 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 YAE1D1-201ENST00000223273 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 MYL7-201ENST00000223364 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 S100B-202ENST00000367071 971 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 SERF2-210ENST00000409960 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 AC007322.2-201ENST00000414540 605 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 AC139795.1-201ENST00000499314 838 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 AC020893.2-201ENST00000506083 723 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 MIR2277-201ENST00000515916 93 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 AP001775.1-201ENST00000532608 586 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 AC002519.2-201ENST00000563575 539 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 RPL37A-212ENST00000600880 425 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 ZNF669-204ENST00000448299 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 FAM204A-202ENST00000369172 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 AC064836.1-201ENST00000405197 704 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 AL008719.1-201ENST00000430449 473 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 DMKN-244ENST00000480502 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 AC005154.1-204ENST00000580902 926 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CC2D2AQ9P2K1 MEMO1-207ENST00000426310 1336 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AC025538.1-201ENST00000510707 1486 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CC2D2AQ9P2K1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms